Pada awalnya masyarakat Mekar Indah Jaya merupakan warga transmigrasi program pemerintah pusat di wilayah kecamatan Menggala Kabupaten Dati II Lampung Utara tahun 1979 yang lebih dikenal dengan nama Unit 9. Seiring perjalanan nama Unit 9 berubah menjadi Desa Balai Murni Jaya. Pada tahun 1984 Desa Balai Murni Jaya dimekarkan menjadi 2 (dua) desa, dengan desa induk Balai Murni Jaya dan desa pemekaran Mekar Indah Jaya. Sejak saat itu desa Mekar Indah Jaya menjadi desa persiapan hingga tahun 1997. Seiring dengan terbitnya Undang-Undang Nomor 2 tahun 1997 tentang Pembentukan Kabupaten Dati II Tulang Bawang dan Kabupaten Dati II Tanggamus. Kecamatan Menggala merupakan salah satu kecamatan yang masuk kedalam wilayah Kabupaten Dati II Tulang Bawang.

Pada tanggal 13 April 1998 Desa Mekar Indah Jaya menjadi Desa Definitif dan menjadi bagian dari Kecamatan Banjar Agung. Pada tanggal 20 Agustus 2009 seiring dimekarkannya Kecamatan Banjar Baru dari Kecamatan induk Banjar Agung, Kampung Mekar Indah Jaya menjadi bagian dari Kecamatan Banjar Baru.

Sejak dimekarkan dari Kampung Balai Murni Jaya , Kampung Mekar Indah Jaya telah dipimpin oleh lima Kepala Kampung, yaitu :

1. Bapak SYAMHUDI dari tahun 1984 sampai tahun 1992
2. Bapak M. MA’RUF dari tahun1992 sampai tahun 2000
3. Bapak DODO SUDIAWAN dari tahun 2000 sampai tahun 2006
4. Bapak RAHAYU dari tahun 2006 sampai tahun 2013
5. Bapak DUDUNG DULHADI dari tahun 2013 sampai tahun 2019
6. Bapak BUDI KUSWARA,SE. dari Tahun 2020 sampai dengan sekarang dengan Keputusan Bupati Tulang Bawang Nomor : B/460/I.1/HK/TB/2019 Pada Tanggal 31 Desember 2019.